I found a מאירי on the above Gemorah I mentioned, regarding eating the donkey that came down from heaven:
“הרבה פעמים מהלכים באוויר, מתוך עיפוש האדים ולסיבות אחרות, שרצים ושאר בריות שפלות שבמיני הרחישות והשריצות, ויורדות בארץ, ודברים אלו אין פקפוק באיסורן כלל. ולא אמרו “אין דבר טמא יורד מן השמים” אלא בדברים שאינם מדרך טבע ותולדות, אלא מדרך מופת, והוא שנלקחו הדברים במיני הבהמות טהורות וטמאות שהן דברים שאי אפשר בהם אלא מדרך שינוי הטבעים וחידוש הבריאה
I wonder if the above statement
שאי אפשר בהם אלא מדרך שינוי הטבעים וחידוש הבריאה can be applied to the above unnatural process and thus will be proof that is permitted. The way I understand it, he is basically saying that the above שרצים created via bacteria and mold etc is all part of nature, but something that is מדרך שינוי הטבעים is a diff category.