Great question! I once said torah on this as follows:
Count the syllables, including all the shva nas, in the following:
מדוע בשש רכבו לבוא מדוע אחרו פעמי מרכבותיו
= 22
Now it says in the next posuk, אף היא תשיב אמריה לה
Which Rashi explains to mean that she said to herself:
מה אני מתמהת על עיכוב בני
Count the syllables:
= 11
Altogether 22 + 11 = 33
Each one was a יללה made up of 3 קולות. So 99. Add a כולל and you have 100